目的 了解北京市区级疾病预防控制中心(以下简称“疾控中心”)机构设置和人员配置现状.方法 2020年4月,对北京市16家区级疾控中心进行调查,按照国家相关规范性文件要求,评价机构设置和人员配置的合理性.结果 16家区级疾控中心在编总人数2196人,在编人数与辖区内常住人口的比例为(0.57～2.54)/万,业务科室数量占所有内设科室数量的比例为56％～81％,专业技术岗位在编人员比例为67％～94％,其中,12家区级疾控中心的在编人数与辖区内常住人口的比例未达到不低于1.75/万的要求,7家区级疾控中心的业务科室所占比例未达到不低于70％的要求,5家区级疾控中心专业技术岗位在编人员比例未达到不低于85％的要求.在编人员组成情况:男女比为1.0:1.8;30～<50岁人群比例占71％;文化程度以本科和硕士为主,占81％;专业以公共卫生和检验专业为主,占72％;职称以中级和初级为主,占73％.2017—2019年16家区级疾控中心共144人离职,以文化程度较高的初级和中级专业技术人员为主.结论 北京市部分区级疾控中心机构设置、人员编制和专业技术人员构成未达到国家相关核定标准.部分区级疾控中心缺乏有较高文化程度的专业技术人才,人员结构不合理,同时存在人才引不来和留不住的双重问题.在疾病预防控制机构(以下简称“疾控机构”)改革中,应加强对全市区级疾控机构的统筹管理,统一机构设置,增加人员编制,优化人员结构,改革激励机制,确保薪酬水平,实现人才总量合理增长、队伍素质大幅提升、队伍结构更加优化的目标.