河南省近年审定小麦品种基于系谱和SNP标记的遗传多样性分析

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为了解河南省近年小麦品种的遗传基础,利用Illumina 90k i Select SNP标记技术对豫麦34及该省2000—2013年审定的小麦品种共96个进行全基因组扫描,分析了其遗传多样性和遗传基础。结果表明,在所有SNP位点中,多态性比率为47.39%(38 661/81 587),多态性标记在基因组间分布呈现B>A>D。96个品种亲缘关系较近,两两遗传相似系数的平均值为0.719,变幅为0.552~0.998,且94.3%的品种间遗传相似系数在0.652~0.812之间;按UPGMA法将96个品种划分为7个类群。综合SNP和系谱分析,近10年河南省审定的96个小麦品种遗传多样性不够丰富,多数品种亲缘关系较近,在育种中迫切需要引入新的种质资源,拓宽遗传背景。 In order to understand the genetic basis of wheat cultivars in Henan Province in recent years, using Illumina 90k i Select SNP marker technology, 96 genomes of Yumai 34 and wheat cultivars from 2000 to 2013 in the province were scanned for genome-wide analysis. The genetic diversity and inheritance basis. The results showed that among all the SNPs, the polymorphism rate was 47.39% (38 661/81 587). The polymorphism markers showed B> A> D distribution among the genomes. 96 cultivars had a close genetic relationship with an average of 0.719 for each pair of genetic similarity coefficients and a 0.552 ~ 0.998 variation range, and 94.3% of the cultivars had genetic similarity coefficients between 0.652 and 0.812. According to the UPGMA method, 96 cultivars were divided For seven groups. According to the comprehensive SNP and pedigree analysis, the genetic diversity of 96 wheat cultivars examined in Henan Province in recent 10 years was not rich enough. Most of the cultivars had close genetic relationship, and it was urgent to introduce new germplasm resources to broaden the genetic background.
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