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文献所载的命门位置可以分为藏神之所、藏精之所、藏气之所3种主要观点.藏神之所分为两途:一以心为中心,包括心上—心包—膻中穴,目为其窍;一以脑为中心,包括脑心—脑—睛明穴,鼻为其窍.藏精之所有四说:左肾、右肾、两肾、男在右肾而女在左肾,前阴为其开窍,耳前为其外候.藏气之所有六说:两肾之间、脐、命门穴、子宫、冲脉之根、丹田.主流之命门应为藏气之所与藏精之所结合的整体:前部以子宫为中心,连接脐,包括脐—子宫至腹壁的空间—子宫—子宫连冲脉之处(冲脉之根);后部以肾为中心,包括两肾—两肾之间-命门穴.