中国HIV-1 vpr基因多态性及其进化树的分析

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目的 分析中国各地HIV-1感染者的vpr基因多态性,比较HIV-1 vpr基因变异的基本特征及其与国外以往研究的异同,为进一步探索HIV-1 vpr的致病机理及可能的基因治疗靶位打下基础.方法 提取348例中国各地区HIV-1感染者血浆病毒RNA,运用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增HIV-1 vpr基因,凝胶电泳鉴定后行基因测序.用Blast、Clustal W、Mega4.0等相关生物分析软件进行vPr基因核苷酸和vpr氨基酸序列分析,并构建进化树,分析中国HIV-1感染者的vpr基因的多态性、变异特征和亚型的分子流行病学特征.结果 按vpr基因分型共发现AB、AE、BC、B、C 5种HIV-1亚型,分别占2.60%,55.19%,2.60%,18.18%,21.43%,其中AE亚型比例最大.观察到vpr氨基酸序列有9个变异率大于20%的位点.结论 首次分析中国感染者的HIV-1vpr基因多态性及其基因进化树的特征,发现一些vpr变异率较大的氨基酸位点,这些Vpr氨基酸序列的变异与其致病能力的关系有待进一步研究.
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