目的测算我国医院运行效率,并研究其与平均住院日的相关性,探讨缩短平均住院日对提高医院运行效率的重要性及相关政策建议。方法基于2003年至2012年我国31个省、自治区、直辖市的省级面板数据,采用超效率数据包络分析方法测算医院运行效率;运用Spearman秩相关系数检验全国及各地区医院运行效率与平均住院日的相关性。结果 2003年至2012年的全国医院运行效率均值上升较为缓慢,多数地区的医院处于运行非效率状态;从全国整体情况看,医院运行效率与平均住院日呈显著负相关;但不同地区间相关性并不一致,中西部地区医院运行效率与平均住院日呈显著负相关,且中部相关性更强,而东部地区医院运行效率与平均住院日的相关性并不显著。结论科学合理设置平均住院日,以效率的改进带动社会效益和经济效益的提升;不同区域应因地制宜提升医院运行效率;有效缩短无效住院日。