Gasdermin基因家族在胃癌中的表达及功能的生物信息学分析

来源 :中国普通外科杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ogldfish
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景与目的:Gasdermin (GSDM)家族由6个重要分子组成,主要负责调控细胞焦亡等多种生物学过程.近来不断有研究表明GSDM家族的表达失调参与多种癌症进程,然而GSDM家族成员在胃癌中的表达、预后、功能和潜在机制研究尚待阐明.本研究旨在通过生物信息学方法系统性的分析GSDM基因家族各成员在胃癌中的作用.方法:使用ONCOMINE、GEPIA2、UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、cBioPortal、TIMER 2.0、DiseaseMeth等多个数据库对GSDM家族分子在胃癌患者中的表达差异、预后价值、功能富集、基因改变、免疫浸润相关性、甲基化改变等方面进行了综合分析.结果:GSDM家族中仅DFNA5在胃癌中明显高表达,表达水平较正常组织升高2.479倍.DFNA5在TNM 2、3、4期的表达明显升高,同时在肿瘤分级2、3级的表达明显升高.GSDM家族中仅DFNA5在胃癌中有预后价值,高表达的DFNA5提示较差的总生存期.GSDM家族中GSDMD的基因变异率最高(19%),GSDMA、GSDMB、GSDMC次之(14%),DFNA5 (8%)和PJVK最低(6%).在胃癌中筛选出186个GSDM相关的共表达基因,这些分子可能通过炎症细胞凋亡、趋化因子反应、急性炎症反应相关的信号通路参与胃癌进程.多数GSDM家族成员的表达与CD4+T细胞、CD8+T细胞、B细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、树突细胞的浸润存在不同程度的显著正相关,仅PJVK在巨噬细胞和树突细胞浸润中呈负相关.GSDMA、GSDMD在胃癌组织中处于低甲基化水平.结论:GSDM家族成员在胃癌中存在表达及功能紊乱.GSDM家族特别是DFNA5分子可能成为胃癌诊断和预后评估的重要肿瘤标志物,为开发新的胃癌治疗靶点提供思路.
其他文献
2021年诺贝尔生理学或医学奖揭晓.科学家大卫·朱利叶斯(David Julius)和阿登·帕塔普蒂安(Ardem Patapoutian)因为发现了“温度和触觉感受器”荣获该奖.作为疼痛领域的研究者,我们早在1999年就开始关注David Julius实验室在1997年克隆成功的辣椒素受体(现在统一命名为TRPV1受体).TRPV1克隆成功以来,本实验室致力于研究TRPV1受体在慢性疼痛中的作用,主要学术贡献为:(1)率先提出了TRPV1受体在慢性炎性痛中的作用;(2)率先提出了TRPV1受体参与内源性
2021年诺贝尔生理学或医学奖结果出炉,大卫·朱利叶斯 (David Julius) 教授和阿登·帕塔普蒂安 (Ardem Patapoutian) 教授因先后发现“温度和触觉感受器”共同获奖.他们的突破性发现,为我们对热觉、冷觉和机械刺激感知形成的理解奠定了基础,也开启了全新的研究方向 [1].
期刊
慢性病已成为我国严重的公共卫生问题.2012年中国居民慢性病死亡率达533/10万,占全部死亡的86.6%[1].2015年全球疾病负担研究(GBD 2015)显示,2015年中国慢性病导致的伤残调整寿命年(DALY)为2.8亿人年,占总DALY的81.3%[2],慢性病严重吞噬着我国经济发展的成果.因此,加强慢性病防控尤为重要.卫生资源是社会在提供医疗卫生服务过程中占用或消耗的各种生产要素的总称,也是实现和维护人群健康的基础和保障,常分为人力、物力、财力、技术和信息[3].卫生资源的拥有量与人群健康水平
目的了解我国成人大骨节病现症患者的口服药物治疗情况,以期为大骨节病治疗药物筛选工作提供理论依据和为大骨节病临床治疗提供科学指导。方法基于"中央补助地方公共卫生专项资金地方病防治项目"和"重大公共卫生服务地方病防治项目",收集我国11个省(自治区,简称省份)2006 - 2017年成人大骨节病现症患者口服药物治疗信息,分析治疗覆盖情况的时间和地区分布,并对不同病情分度患者的疗效进行评估。结果2006
目的掌握内蒙古自治区扎兰屯市大骨节病病情变化和考核验收情况,为制订大骨节病防治策略提供科学依据。方法2016、2017年,在扎兰屯市下辖的每个县抽取5个病区乡镇,每个乡镇抽取3个病区村,调查病区村内全部7 ~ 12岁居住6个月以上的常住儿童的大骨节病患病情况。按照《大骨节病诊断》(WS/T 207-2010)标准进行临床和X线诊断,比较2016和2017年扎兰屯市7 ~ 12岁儿童的大骨节病患病情
胰腺癌恶性程度高,预后差,目前群体研究证据所提供的治疗方案对改善胰腺癌的预后效果有限.究其原因,还是由于胰腺癌高度恶性的生物学行为以及个体间的异质性造成了其治疗效果的差异.精准治疗模式在癌症领域的蓬勃发展也为胰腺癌的治疗带来了新的希望.目前胰腺癌在靶向治疗、分子分型、个体化肿瘤模型等方面都有了一些进展,为精准治疗模式在胰腺癌治疗领域的应用提供了基础.胰腺癌的四大驱动突变(KRAS、TP53、CDKN2A、SMAD4)在胰腺癌的发生发展中起着重要作用,但目前还缺乏相对应的靶向药物.Ⅱ期临床试验证实AMG51