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动物医学系是郑州牧业工程专科学校办学最早、实力最强的主干系之一，是农牧行业特有工种职业技能培训鉴定基地，现设有兽医、动物防疫与检疫、宠物医学、宠物养护与疫病防治、宠物养护与疫病防治（宠物医学检验方向）、猪生产与疾病防制等6个专业及方向。兽医专业是国家级教学改革试点专业、河南省示范专业、河南省高校首批特色专业。