菠萝蜜BRI1家族成员生物信息学的预测与对比

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菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)是热带地区常见的木本植物之一,具有较高的经济和科研价值.本研究采用己完成菠萝蜜幼苗茎叶的全长转录组测序(PRJNA579273),在此基础上对菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)BR INSENSITIVE 1(BRI1)家族成员AhBRI1、AhBRL1和AhBRL2进行生物学信息分析,将基因翻译成蛋白.以菠萝蜜为主,将其与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、川桑(Morus notabilis)和毛果杨(Populus trichocarpa)利用在线分析工具分析得到不同的理化性质数据以及蛋白的二、三级结构.得到不同物种BRI1蛋白家族之间生物信息学的预测与对比.结果表明,其氨基酸残基数分别为1 195,1 170和985,理论等电点为6.32、5.77和7.08,蛋白呈弱酸性,具有一定亲水性,较为稳定;存在分泌途径信号肽或叶绿体转运肽,具有跨膜结构;二级结构主要元件为无规则卷曲和a-螺旋,三级结构为螺旋管状结构.本研究为进一步对菠萝蜜BRI1蛋白家族成员的功能研究提供依据.
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