新三板实施分层制度的实质是通过差异化的监管安排实现对不同风险企业分层管理,目的是筛选和培养一批优质创新层企业并以此带动整个市场的发展。时至今日,分层制度已实施两年有余,是否有效促进创新层企业的发展呢?笔者对此进行了一系列研究。选取新三板6 668家公司2014年至2017年半年度数据,基于PSM-DID法以创新层企业为实验组从股票流动性、股票估值、增发融资、公司治理和企业绩效等五个方面对分层制度的影响进行了实证研究,结果表明:与普通层企业相比,分层制度的实施显著提高了创新层企业股票的流动性、股票估值,但是其公司治理水平不仅没有提高反而与进入创新层之前相比下降了,公司绩效也没有明显的改善,稳健性检验支持了这一结论。此外,分类研究表明:实体行业中的民营企业和小微企业获益最大,但其融资困难、绩效低下的现实并无显著改善,而且激励了这些企业控股股东的代理人行为。因此,建议进一步完善差异化的监管制度使创新层企业质量得到实质性改善。