环境16S rDNA和16S rcDNA序列分析湖光岩玛珥湖的浮游细菌组成

来源 :广东海洋大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：yingying0615

【摘要】

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通过提取环境总16S rDNA和总16S rRNA分别构建DNA克隆文库和反转录cDNA文库,并进行克隆测序和序列分析,探讨湖光岩玛珥湖浮游细菌和浮游活性细菌的遗传多样性。结果表明：构建

【作者】

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秦青英曾永辉郭倩茹简纪常鲁义善吴灶和

【机构】

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广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,仲恺农业工程学院

【出处】

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广东海洋大学学报

【发表日期】

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2013年3期

【关键词】

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湖光岩玛珥湖浮游细菌浮游活性菌 16S rDNA 16S RRNA 系统发育分析遗传多样性 Huguangyan Maar Lake bacteriop

【基金项目】

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国家自然科学基金青年项目（No.30900045）,广东省自然科学基金博士启动项目（No.B09292）

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通过提取环境总16S rDNA和总16S rRNA分别构建DNA克隆文库和反转录cDNA文库,并进行克隆测序和序列分析,探讨湖光岩玛珥湖浮游细菌和浮游活性细菌的遗传多样性。结果表明：构建两个水层的4个克隆文库,即1 m和10 m水层总菌的16S rDNA文库和总活性菌的16S rcDNA文库,共获得413条序列,分属15门、32目、52科;1 m水层的rDNA文库与rcDNA文库中Verrucomicrobia类群所占比例最大（36.8%和32.1%）,其次为Alphaproteobacteri（a 15

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