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启动子识别是生物信息学的一个重要研究方向,根据启动子本身的特点已经有基于信号、内容和CpG岛等多种识别算法。针对基因序列数据数据量大、维数高、非线性的特点,提出了基于流形结构重建的启动子识别算法,先利用非线性降维方法压缩数据,然后再进行启动子识别。实验结果表明,该方法能够取得较好的结果。