猪脑心肌炎病毒NJ08株基因组序列测定与分析

来源 :中国预防兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：liongliong599

【摘要】

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为测定猪源脑心肌炎病毒（EMCV）NJ08分离株全基因序列,本研究应用RT-PCR方法分5个基因片段扩增NJ08分离株的基因组,同时应用3＇-RACE和5＇-RACE技术扩增3＇-UTR和5＇-UTR,分别克隆于pMD1

【作者】

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白娟蒋康富李玉峰王先炜姜平

【机构】

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南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室

【出处】

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中国预防兽医学报

【发表日期】

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2011年5期

【关键词】

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脑心肌炎病毒基因组序列分析 encephalomyocarditis virus genome sequence analysis

【基金项目】

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教育部重点项目（104101）, 国家自然科学基金（30871868）, 国家重大转基因专项（2009ZX08009-143B）

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为测定猪源脑心肌炎病毒（EMCV）NJ08分离株全基因序列,本研究应用RT-PCR方法分5个基因片段扩增NJ08分离株的基因组,同时应用3＇-RACE和5＇-RACE技术扩增3＇-UTR和5＇-UTR,分别克隆于pMD18-T载体中进行测序,获得EMCVNJ08株全基因组cDNA序列,并将全基因组及其推导的氨基酸序列与GenBank中登录的国内外参考病毒株进行同源性比较及系统进化分析。结果表明：EMCVNJ08分离株基因组全长7724bp;属于Ia亚群;与GXLC、GX0602、BJC3、HB1等国内分离

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