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介绍了基于AVR单片机的多轴差分吸收光谱仪（multi-axis differential optical absorptionspectroscopy,MAX-DOAS）控制系统设计。采用Atmega128 AVR单片饥实现MAX-DOAS系统的数据通信、背景电机控制、扫描电机控制及温度检测和控制,并给出了整个控制系统的电路设计方案及软件实现过程。设计的控制系统可以使MAX-DOAS系统实现痕量气体垂直柱浓度与廓线的自动监测。