间隔区寡核苷酸分型运用于西藏自治区藏族结核分枝杆菌临床分离株的基因多态性分析

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目的 了解西藏自治区藏族结核分枝杆菌的基因多态性,优势流行菌株及相关影响因素.方法 采用间隔区寡核苷酸分型对577株西藏自治区藏族结核分枝杆菌进行分型,应用BioNumerics 5.0软件对分型结果进行聚类分析,并与SITVIT2数据库作比对分析.结果 577例西藏自治区藏族结核病患者中,男329例,女248例.577株结核分枝杆菌可分为23种基因型,基因多态性为3.99%.其中563株(97.57%)表现出12种已知的基因型,分属为北京家族、T家族、CAS家族和MANU2家族,另有14株表现出11种新的基因型.对577株菌株的基因家族进行分析发现,北京家族菌株最多,共522株(90.47%),表现出7种基因型,基因多态性为1.34%.北京家族菌株之间的相似性较高,可聚为一个大的基因群,而在非北京家族菌株中,T家族与MANU2家族的相似性较高,可构成一个基因群,而与CAS家族的相似性较低.北京家族菌株比例最高的地区为昌都(97.83%).北京家族菌株的发生与性别、年龄、卡介苗接种情况和治疗史均不相关(P值分别为1.00、0.36、0.83和1.00).结论 西藏自治区藏族结核分枝杆菌的基因多态性低,其中北京家族菌株为主要的流行菌株。

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