短杆菌肽A—DMPC通道内离子输运的分子动力学模拟

来源 :生物物理学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liuyunxiaoyan
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用最近提出的构建膜体系初始构象的有效方法,构建了在DMPC脂膜环境下短杆菌肽A通道模型(GA-DMPC)。通过对Na^+、C^2+、Cl^-三种不同离子在GA-DMPC通道内不同位置的分子动力学模拟,研究离子在通道内输运过程中与通道及通道内水分子的相互作用,从分子动力学的角度阐明离子在通道内的输运机制。主要计算结果表明:⑴离子在通道内的输运使GA的构象发生变化,GA的柔性是离子在通道内通透的重要因
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