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利用fAFLP标记技术和PCR—RFLP技术，对采集于广西的形态和壳色变异很大的2个文蛤群体（G、W）以及山东文蛤（S）群体进行了遗传结构和亲缘关系研究。fAFLP分析显示：在457个总扩增位点中存在53个W群体的特异性位点（其中9个为100％显性）、21个G群体的特异性位点、14个S群体的特异性位点，这些位点可作为群体鉴别的特征性标记；通过计算群体间相对遗传距离和聚类分析，发现S和G间的遗传距离最小（0．0424），在系统树上首先聚在一起，而W与S、G的相对遗传距离均很大（0．2308和0．2305），