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简要说明了一些医院感染监控的特征和微生物学的分型方法，重点阐述了应用在医院感染监控和流行病学调查的分子生物学方法，这些分子生物学方法主要包括两类；（1）蛋白质检测技术，如同工酶电泳，免疫印迹技术，（2）DNA检测技术，如质粒分析，染色体DNA的限制性核酸内切酶技术，核糖分型，脉冲电场凝胶电泳和PCR技术，最后列举了一些分子生物学方法在流行病学调查和医院感染监控中的应用。