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衣原体感染与多种慢性疾病密切相关,其主要外膜蛋白（MOMP）是一种多功能蛋白,分别与外膜结构的稳定性、生长代谢调节、抗原性和毒力密切相关.随着沙眼衣原体和肺炎衣原体基因组测序的完成,人们得以揭示其重要的生物合成、代谢途径,确定调控机制及其与致病的相关性.利用分子生物学技术在分子水平分析衣原体主要外膜蛋白的结构、抗原表位,对于免疫防御、免疫病理和免疫诊断均有重要意义.本文综述了衣原体主要外膜蛋白的分子结构、基因特性、抗原表位与应用前景.