北京大学体育健康中心成立于2002年，是普通高等院校中首家以“关注健康”为主题，以体质监测、健身指导及健康促进为研究方向的专门性研究机构。健康中心目前有研究人员7人，其中外聘顾问3人，对外合作机构2家。
　　北京大学体育健康中心以实现身体锻炼科学化、大众化、终身化为最终发展目标，为师生提供体质测评、健身指导及健康促进的咨询与服务。“体质健康管理平台”致力于“阳光体育运动”体质健康管理系统的研发与应用。“运动与心理研究部”开展体育和心理健康方面的相关研究，研发和推广以体育为基本方法强健身心的课程与教学方法、研发和推广体育和心理健康相关的测评标准和测评工具等。
　　中心为全校师生员工健康服务，设有体质健康监测室一个。拥有学生体质健康测试仪器、成人体质健康测试仪器、健康风险评估设备、运动风险评估设备等。10余年来，中心每年为1万余人进行体质健康标准测试工作，定期向国家数据库上报测试数据，并出具北京大学学生体质健康年度报告及为学生提供个性的健身运动处方。
　　中心先后承担教育部、国家体育总局、北京市教育科学规划领导小组等机构设置的科研课题。主要研究方向包括：（1）青少年体质发展规律研究；（2）高知人群健康水平评估及运动干预；（3）健身运动处方的应用研究；（4）大学生运动与健康的行为干预；（5）运动与心理健康；（6）体质健康系统化管理。