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公共卫生体系建设过程中，医疗机构是重要的组成部分。虽然医疗机构主要职能是医疗服务，但是医疗机构在疾病控制工作中的地位也越来越重要。尤其是非典流行过程中，大量的医务人员被感染；另外，丙肝医源性感染、非安全注射造成乙肝传播、麻疹流行过程中医院作为传染源的集散地也成为传播重要因素等实例表明，做好疾病控制工作首先要做好医疗机构的管理工作。