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原子时算法是得到一个高可靠性,高准确性,长期稳定的时间尺度的重要因素。详细介绍了几种经典且广泛使用的原子时算法,从理论上分析了ALGOS算法、Kalman算法和AT1算法数学模型,并且根据对算法过程的研究,对比得到了各算法的优缺点。分析得出:ALGOS和AT1是经典的加权平均算法;Kalman和AT1是实时性的算法;Kalman滤波算法能更好地处理噪声的影响,适用于卫星导航系统。