【摘 要】
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目的通过对癌症和肿瘤基因图谱（TCGA）公共数据库中肝细胞癌病例癌和癌旁组织RNA测序数据的分析，挖掘与肝细胞癌预后相关的长链非编码RNA（lncRNA）分子标签。方法截至2018年2月，从TCGA数据库中获得377例肝细胞癌病例的癌及癌旁组织RNAseq数据及临床预后信息，将50对癌和癌旁组织的lncRNA表达水平进行差异t检验分析，进而采用LASSO Cox回归分析筛选肝细胞癌预后相关的lnc
【机 构】
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华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系 环境与健康教育部重点实验室，武汉 430030,华中科技大学同济医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学系 环境与健康教育部重点实验室，武汉 430
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目的通过对癌症和肿瘤基因图谱（TCGA）公共数据库中肝细胞癌病例癌和癌旁组织RNA测序数据的分析，挖掘与肝细胞癌预后相关的长链非编码RNA（lncRNA）分子标签。
方法截至2018年2月，从TCGA数据库中获得377例肝细胞癌病例的癌及癌旁组织RNAseq数据及临床预后信息，将50对癌和癌旁组织的lncRNA表达水平进行差异t检验分析，进而采用LASSO Cox回归分析筛选肝细胞癌预后相关的lncRNA，并构建lncRNA分子标签。将所有病例按分子标签表达水平分为4组（<P25、P25~、P50~、≥P75），采用Cox回归计算P25~、P50~、≥P75组相对于<P25组的预后风险比，进而评估分子标签表达水平对肝细胞癌病例总体生存率的影响。
结果筛选出951个癌和癌旁组织中表达水平有统计学意义差异的lncRNA，通过LASSO Cox回归分析进一步筛选出3个lncRNA（LNCSRLR、MKLN1-AS及ZFPM2-AS1），并构建分子标签。分子标签表达水平≥P75组的死亡风险是<P25组的1.57倍（95%CI：1.06~2.31，P<0.05）。
结论通过对TCGA数据库的挖掘，由LNCSRLR、MKLN1-AS及ZFPM2-AS1构建的lncRNA分子标签表达水平与肝细胞癌病例的预后有关。
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