2012~2016年新疆柯萨奇病毒A6的分子流行病学特征分析

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分析新疆手足口病相关的柯萨奇病毒A6(Coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区基因特征。2012~2016年从新疆手足口病病例标本中分离到75株CV-A6,对75株CV-A6采用RT-PCR方法扩增VP1区基因片段并进行核苷酸序列测定,应用MEGA5.05和BioEdit7.1.9软件进行核苷酸序列比对分析,构建系统进化树。75株新疆CV-A6毒株VP1区核苷酸序列同源性为86.9%~100%,与原型株(Gdula)同源性为81.4%~82.5%;71株D3亚型株与D3代表株之间核苷酸
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