长链非编码RNA在结肠癌中的表达研究

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目的 探讨长链非编码RNA (lncRNA)在结肠癌中的表达情况.方法 从公共数据平台Gene ExpressionOmnibus (GEO)下载结肠癌外显子芯片数据集GSE31737,包含40对结肠癌及癌旁组织.对外显子芯片探针进行重排,筛选出在基因水平特异性匹配lncRNA的探针.用Affymetrix Power Tools分析获得lncRNA表达谱,用LIMMA分析在结肠癌和癌旁组织中差异表达的lncRNA.结果 共有136 053个探针特异性匹配9294个lncRNA,约包含了Ensembl数据
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