【摘 要】
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目的 运用网络药理学的方法分析预测紫草素(Shikonin)作用于鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)的相关靶点及通路,探究其可能的作用机制并通过实验进行验证.方法 通过Pubchem、Pharmmapper、GeneCards等数据库获得紫草素的相关靶点,然后运用David数据库对靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,
【机 构】
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广西医科大学 生命科学研究院,广西 南宁 530021;广西医科大学 生物化学与分子生物学教研室,广西 南宁 530021;广西医科大学 药学院,广西 南宁 530021
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目的 运用网络药理学的方法分析预测紫草素(Shikonin)作用于鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma,NPC)的相关靶点及通路,探究其可能的作用机制并通过实验进行验证.方法 通过Pubchem、Pharmmapper、GeneCards等数据库获得紫草素的相关靶点,然后运用David数据库对靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,最后构建出“药物-靶点-疾病-通路”关系网络.通过CCK-8实验检测紫草素对鼻咽癌CNE-2细胞在不同浓度和时间的增殖抑制情况,再运用蛋白质印迹法(Western blotting)对预测出的通路进行验证.结果 网络药理学结果显示,紫草素抗鼻咽癌的潜在作用靶点有109个,通过GO功能注释获得分子功能条目19条、生物过程条目17条和细胞组成条目13条,并通过KEGG通路富集得到16条相关通路,涉及到调控癌症信号通路、癌症蛋白聚糖通路、叉头转录因子O亚族(forkhead transcription factor of the O class,FOXO)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、磷脂酰肌醇-3激酶(phosphatidylinositol-3-kinases,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)信号通路、催乳激素信号通路等.CCK-8实验结果显示紫草素对鼻咽癌CNE-2细胞的增殖具有明显抑制作用,并且抑制效果随着浓度梯度的升高和作用时间的延长而逐渐增强.WB实验结果还显示MAPK1信号通路中ERK和p-ERK蛋白表达明显下调(P<0.05).结论 紫草素可有效的抑制鼻咽癌CNE-2细胞的增殖,其抗鼻咽癌机制可能与抑制MAPK/ERK信号通路活性有关.
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