坛紫菜PhGME基因克隆及差异表达分析

来源 :集美大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:yaoyaoqi
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GDP-甘露糖-3,5-表异构酶(GME)是抗坏血酸合成过程中的关键限速酶.以坛紫菜(Pyropia haitanensis)转录组测序获得的unigene序列为基础,采用普通PCR技术克隆获得了坛紫菜编码GME的基因序列PhGME.序列分析结果表明,PhGME基因序列全长1411 bp,包含一个1260 bp的开放阅读框,所编码的多肽包含419个氨基酸,相对分子质量为46.46 ku,理论等电点为6.76,具有GME特有的底物结合位点.多序列比对和系统进化树分析结果显示,PhGME与角叉菜同源且关系较近.差异表达分析结果表明,随着高盐胁迫时间的增加,TK品系处理组坛紫菜PhGME基因的表达水平均显著高于对照组,同时TK品系的AsA含量在胁迫处理6 h后明显增加.由此推测该基因的上调表达可能有助于抗坏血酸的合成,进而调控藻体抵抗盐胁迫.以上结果说明,PhGME在坛紫菜应对盐胁迫过程中发挥着重要作用,为坛紫菜抗逆功能的研究提供了理论参考.
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