近年来，我国西南流域陆续建成多座梯级高坝大库工程，随之形成的大面积水库消落带面临着植物恢复等问题，能否借鉴三峡库区消落带已有的大量植物修复成果和经验尚缺乏科学依据。通过对2021年出露期三峡库区和西南库区消落带现存植物进行调查，采用淹水时间统一划分淹水梯度带，淹水时间7个月及以上为重度淹水区（S）、淹水时间为5～6个月为中度淹水区（M）和淹水时间4个月及以下为轻度淹水区（L），定量比较了三峡库区和西南库区消落带沿各淹水梯度的物种组成、物种多样性和系统发育多样性，探讨了水库消落带物种组成的驱动因子、植物群落构建策略以及多样性维持机制等。结果显示，三峡库区消落带共发现维管束植物20科36属36种，西南库区消落带共发现维管束植物21科41属45种，二者物种组成的Jaccard、Sorensen相似性系数分别为30.65%、46.91%，均以一年生为主要生活型、菊科和禾本科为优势科，相似的淹水时间可能是导致二者物种组成相似的主要因素；西南库区消落带的Gleason丰富度指数、Shannon-Wiener多样性指数、Simpson优势度指数和Pielou均匀度指数整体优于三峡库区消落带，二者物种多样性均与淹水时间呈负相关，物种多样性的维持可能受环境筛选、种子扩散限制、生境异质性和区域种库的联合作用；三峡和西南库区消落带的群落系统发育水平均较低，也与淹水时间呈负相关，前者增长幅度更大，至L段系统发育水平已显著高于后者；除西南库区L段谱系结构无明显趋势外，三峡库区和西南库区消落带在整体水平上和在各淹水梯度段，植被谱系结构呈发散趋势，主要由远缘种组成，群落构建由随机过程主导。