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在用遗传算法求解TSP时，极易破坏已经发现的较短线路片段，从而使遗传算法的收敛变慢。为了保护较短的线路片段，遗传操作以基因和基因簇为单位进行，优良基因簇可完整地遗传到下一代。在获得第一个近似最优解后，粉碎已发现的基因簇并继续寻优，以期能够获得全局最优解。使用CHN144及TSPLIB中的数据进行试验，找到了CHN144问题的当前最优路径。通过对TSP225的实验获得了最短路径3859，优于目前已经公布的最短路径3916。实验表明，基于基因簇的算法具备3000个城市左右的寻优能力。