【摘 要】
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研究表明mRNA的序列和结构特性与蛋白质的亚细胞定位有一定关系。本文提取了细胞凋亡蛋白质的两种mRNA信息:三阅读框3-mer mRNA序列频数信息、mRNA二级结构-序列模式信息,并
【基金项目】
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国家自然科学基金(61361015),教育部第46批留学回国人员科研启动基金的支持
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研究表明mRNA的序列和结构特性与蛋白质的亚细胞定位有一定关系。本文提取了细胞凋亡蛋白质的两种mRNA信息:三阅读框3-mer mRNA序列频数信息、mRNA二级结构-序列模式信息,并结合细胞凋亡蛋白质的氨基酸物理化学性质、氨基酸黏性特征和进化信息,构成特征向量来表示mRNA和蛋白质序列,利用支持向量机算法,对四种不同亚细胞位置的细胞凋亡蛋白质进行预测。研究发现融合mRNA信息与氨基酸信息后预测效果更佳,在Jackknife检验下,预测总精度达到82.18%,且独立测试集预测总精度达到78.26%。结果表
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