【摘 要】
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木薯(Manihot esculenta Crantz)是世界重要的粮食作物,块根中富含淀粉,而苹果酸脱氢酶(MDH)在淀粉和糖代谢中具有重要作用。本研究采用生物信息学方法,对木薯MDH的其氨基酸
【机 构】
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黑龙江八一农垦大学农学院; 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部木薯种质资源保护与利用重点实验室;
【基金项目】
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NSFC-CGIAR国际合作重点项目(31361140366);国家科技支撑项目(2015BAD15B01);2012年海南省创新创业人才启动基金共同资助
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木薯(Manihot esculenta Crantz)是世界重要的粮食作物,块根中富含淀粉,而苹果酸脱氢酶(MDH)在淀粉和糖代谢中具有重要作用。本研究采用生物信息学方法,对木薯MDH的其氨基酸序列、导肽、跨膜结构域、亲/疏水性、二级和三维结构及功能域进行分析及预测。结果表明,MDH在8种植物中的氨基酸组成成分基本一致,二级结构最大元件均为α-螺旋;MDH在大麦中为叶绿体基质蛋白,在小麦中为细胞质基质蛋白,木薯及其他作物中为线粒体基质蛋白;MDH在木薯中有2个功能域。以野生木薯近缘种W14(M.esculenta ssp.flabellifolia)块根为对照,利用q RT-PCR从转录水平对野生橡胶木薯(M.glaziovii)和栽培种SC205和SC8块根的MDH基因表达进行分析,发现MDH基因在橡胶木薯、SC205和SC8中均下调表达,这些结果对进一步验证木薯MDH的生物学功能提供重要依据。
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