目的 根据上海市疾病预防控制(以下简称“疾控”)体系现代化建设相关政策要求和建设目标,调查2020年末上海市区级疾控机构基线建设进展和区域间的均衡性情况,为全面推进疾控体系现代化建设,指导后期机构发展提供循证决策依据.方法 结合文献检索、问卷调查及现场访谈等方法,调查2020年末上海市全部16家区级疾控机构的建设发展情况.采用中位数和四分位数间距等指标描述主要指标分布.采用基尼系数、公共卫生资源聚集度等方法分析各区疾控机构软硬件水平和公共卫生资源配置的均衡性.结果 至2020年末,上海市各区疾控机构在基础设施和硬件、财政保障、人才队伍、实验室能力、卫生应急能力、学科建设等方面发展水平较好,相对全国和东部各省处于较高水平.但各区疾控机构在不同领域的建设进展存在一定差异,且与上海市的建设要求仍有一定距离.综合区域人口和服务面积看,部分区疾控机构的建设水平和公共卫生资源配置需要进一步加强.结论 至2020年末,上海市各区疾控机构的建设发展已取得阶段性成效.在下一阶段,需结合各区的人口、面积、主要健康问题和服务需求等,加快基础设施、实验室能力和卫生应急装备配置等方面的建设进展.