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以福建福州和厦门两市为研究对象,对其城市主要生态流进行计算和归类,建立相应的城市复合生态系统与可持续发展能值指标,并对两城市复合生态系统中自然、经济、社会子系统进行能值综合评估与对比分析.结果表明,厦门在经济发展水平和社会人均福利优于福州;在生态安全和可持续发展能力则落后于福州.从能值角度出发,福州应加快城市基础设施建设,加强城郊地区能值反馈,科学引导人口转移;厦门应积极发展绿色产业,降低生产能耗、物耗,提高废弃物循环利用率;两城市应加强区际资源互补和消除技术壁垒,促成两城市互补、互利,可持续发展.