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2008～2009年,采用＂3S＂技术对祁连山自然保护区森林结构现状特征进行了调查,并与2000年调查结果进行对比分析,表明保护区林地以灌木林为主,占林地总面积的74.6%;其次为有林地,面积占林地的21.3%;森林起源主要为天然林,森林树种结构单一。灌木林树种主要为金露梅、柳类、锦鸡儿、杜鹃、珍珠猪毛菜等。乔木林以青海云杉和祁连圆柏为优势树种。有林地龄组结构基本合理。林分郁闭度中等偏高。提出了森林结构调整意见。