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高效液相色谱仪已被用于测定支链淀粉的绝对分子量，不同种类的淀粉中单个支链淀粉分子量在7．0×10^7-5.7×10^9g/mol。支链淀粉所特有的束状结构和双峰分布，是支链淀粉有别于其它葡聚糖的特征，支链淀粉的晶体结构的差异与支链长度有关。在普通小麦及普通玉米的支链淀粉中，发现了特别长的支链，A型淀粉的支链键较分散，连接的支链较多，而B型粉的支链键集中，连接的支链很少，支链淀粉的支结构与淀粉的物理性质有密切的关系，不同的淀粉酶可使A淀粉高度水解，而B-型淀粉却很耐酶解，C型淀粉介于两者