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高分辨电镜研究发现渔塘坝硒矿石中硒主要以独立硒矿物和类质同象两种形式存在.独立硒矿物主要以自然硒大量出现,以有机吸附所占比重较大,而较少出现硒铁矿、硒银矿、蓝硒铜矿、硒铜蓝、方硒铜矿等独立硒矿物.以类质同象形式存在的硒,在Fe-S-Se系列中,以不同量替代S,形成的含硒黄铁矿和硒黄铁矿,颗粒很细,大多为纳米级(<100nm).