蚕豆染色病毒RNA2全序列测定

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采用RT-PCR扩增并测定蚕豆染色病毒(Broad bean stain virus,BBSV)RNA2的基因组序列。BBSV RNA2基因组全长3478 nt,5’非编码区和3’非编码区分别为268 nt和237 nt。RNA2编码的多聚蛋白经切割后产生辅助蛋白(CR)、移动蛋白(MP)、大外壳蛋白(CP-L)和小外壳蛋白(CP-S)。基于多聚蛋白P2氨基酸序列构建的系统树显示:侵染豆科作物的Comovirus病毒构成1个分支,表明Comovirus病毒之间的亲缘关系具有寄主相关性。 The genomic sequence of RNA2 from broad bean stain virus (BBSV) was amplified by RT-PCR. The full length of BBSV RNA2 genome is 3478 nt, with 268 nt and 237 nt in the 5 ’and 3’ noncoding regions respectively. RNA2-encoded polyprotein is cleaved to produce accessory proteins (CR), mobile protein (MP), large coat protein (CP-L) and small coat protein (CP-S). The phylogenetic tree based on the polyprotein P2 amino acid sequence showed that the Comovirus virus that infects leguminous crops constitutes a branch, indicating that the genetic relationship between the Comovirus viruses is host-related.
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