越南槐(Sophora tonkinensis)种子萌发响应钙离子胁迫的转录组分析

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越南槐(Sophora tonkinensis)是贵州喀斯特地区典型药用植物。为挖掘参与越南槐种子萌发响应钙离子胁迫的关键基因,开展了RNA-seq研究。本研究以越南槐种子为材料,经0、50、100 mmol/L CaCl2溶液处理直至其萌发,取样并用于分析。结果显示,共鉴定到742个差异表达基因,差异表达基因主要涉及氨基酸代谢、糖代谢、次生代谢、脂代谢及其他代谢途径。本研究重点分析了氨基酸代谢中丝氨酸羟甲基转移酶基因、同型半胱氨酸S-甲基转移酶基因、S-腺苷甲硫氨酸合酶基因、1-氨基环丙烷-1-羧酸合酶基因、谷氨酰胺合酶基因、天冬酰胺合酶基因和δ-1-吡咯啉-5-羧酸合成酶异构体X1基因等基因,糖代谢中淀粉磷酸化酶基因、酸性β-呋喃果糖苷酶基因、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因、磷酸甘油酸激酶基因、磷酸甘油酸变位酶基因、丙酮酸脱羧酶基因,以及6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶基因和乌头酸酶基因,为进一步解析越南槐响应钙离子的分子机制提供了新的数据资源和理论依据。
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