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[目的]作物抗性性状是重要的育种目标,通常表现为多个级别,称为多歧性状。但是,这类性状的上位性关联分析方法较少。因此,本研究针对品种资源群体探索了新的多歧性状上位性检测方法。[方法]提出了多歧性状分层广义混合线性模型的上位性关联分析方法。在遗传模型中,主效QTL、QTL间互作和QTL-环境互作为随机效应,群体平均数、群体结构和环境效应为固定效应。应用经验贝叶斯和最大似然方法分别估计这些效应。一系列Monte Carlo模拟试验和大豆耐盐碱性实际数据分析验证了新方法的有效性。[结果]新方法的统计功效高,效应