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目的利用宏基因组技术建立一种新的自来水细菌总数检测方法。方法采用国标法检测自来水中的菌落总数约为(165±5)CFU/ml。如果检测样品量为1 L,折算1 L符合国标限值的自来水对应600 ml本实验用水,滤膜过滤法提取国标限值及其他体积该自来水的细菌总基因组,电泳分析,计算样品与限值总基因组主条带的亮度比值,比值近似或小于1则样品合格,否则不合格。结果借助Image J图像分析软件对总基因组电泳结果进行亮度分析,85、120、170与100 CFU/ml的自来水中的总基因组亮度比分别为0.95、1.6、1.9。结论宏基因组技术可以用于自来水中细菌总数的定量分析,该方法检测的结果与国标法一致,区分度约为15 CFU/ml,且相对省时、重复性好。