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于2005年12（平水期）、2006年3月（枯水期）及2006年7月（丰水期）对南明河花溪大坝、甲秀楼、水口寺、普渡桥4个河道段面进行了理化因子及浮游植物群落结构的调查研究，结果是水口寺段水体污染最严重，总氮含量最高达26．2mg／L，城区里的河道中的水体已处于富营养化状态。浮游植物的香农（Shannon）及马格利夫（Margalef）多样性指数在水口寺处总体最低，最高值分别没有达到1和1．2。水质段面好坏规律是：花溪大坝〉甲秀楼〉水口寺〉普渡桥。