【摘 要】
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目的 对奶牛乳腺上皮细胞来源外泌体中bta-miR-126-5p的候选靶基因进行预测,利用相关生物信息学技术对靶基因进行功能分析,为bta-miR-126-5p的功能验证奠定基础.方法 应用Targetscan和miRWalk在线分析系统预测bta-miR-126-5p的候选靶基因,利用DAVID、STRING、KEGG等生物信息分析系统对靶基因进行GO富集、蛋白质互作、KEGG富集分析.结果 bta-miR-126-5p成熟区序列在不同物种间高度保守,共筛选出203个bta-miR-126-5p的候选靶
【机 构】
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黑龙江八一农垦大学动物科技学院,黑龙江大庆163319;黑龙江八一农垦大学动物科技学院,黑龙江大庆163319;黑龙江省牛病防制重点实验室,黑龙江大庆163319
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目的 对奶牛乳腺上皮细胞来源外泌体中bta-miR-126-5p的候选靶基因进行预测,利用相关生物信息学技术对靶基因进行功能分析,为bta-miR-126-5p的功能验证奠定基础.方法 应用Targetscan和miRWalk在线分析系统预测bta-miR-126-5p的候选靶基因,利用DAVID、STRING、KEGG等生物信息分析系统对靶基因进行GO富集、蛋白质互作、KEGG富集分析.结果 bta-miR-126-5p成熟区序列在不同物种间高度保守,共筛选出203个bta-miR-126-5p的候选靶基因,候选靶基因主要参与金属离子结合(尤其是锌离子结合)以及ATP结合等细胞内部分子功能过程,富集的信号通路集中于脂肪酸生物合成及降解、嘌呤代谢、丙酸盐代谢、磷酸肌醇代谢.结论 bta-miR-126-5p可能通过调节候选靶基因参与相关生物学进程,在奶牛炎症反应过程和生理性代谢活动中发挥重要作用.
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