结合PCA和GWAS解析甘蓝型油菜株型相关性状的遗传调控位点

来源 :中国油料作物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：ymlazy62

【摘要】

：

作物株型改良是提高收获指数和产量的重要途径,为了解其复杂的遗传调控机制,以373份甘蓝型油菜组成的自然群体为基础,对4个株型相关性状(株高、第一分枝高度、有效分枝数和主花序长度)进行多环境下表型鉴定,组合利用全基因组关联分析(GWAS)和主成分分析(PCA)方法对株型的遗传调控进行解析。研究表明,PCA可以合理地解释株型的相关表型,基于主成分的GWAS和基于单个性状的GWAS的结果可互相验证和互为补充,挖掘更多的调控位点和信息。进一步,从染色体A01、A10和C06中筛选到19个株型相关的候选基因,其中,

【作者】

：

张旭 Luqman Bin Safdar 唐敏强刘越英张园园刘胜毅

【机构】

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西南大学数学与统计学院,中国农业科学院油料作物研究所/农业农村部油料作物生物学与遗传育种重点实验室

【出处】

：

中国油料作物学报

【发表日期】

：

2021年3期

【关键词】

：

植物株型甘蓝型油菜主成分分析全基因组关联分析

【基金项目】

：

国家自然科学基金(11701471),重庆市基础科学与前沿技术研究(cstc2017jcyjAX0476),国家自然科学基金青年科学基金(31801730),中国博士后科学基金面上项目(2016M601188),中国博士后科学基金(2018T110166)。

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