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目的 结合目前福建省疟疾消除阶段的实际监测防治现状,分析研究福建省消除疟疾3个阶段的成本效益.方法 运用成本效益分析方法,分析2005-2018年福建省疟疾消除阶段前期、消除阶段后期和消除后阶段不同监测措施的效益成本比值(BCR)和经济净效益(NB).结果 福建省2005-2018年消除疟疾3个阶段年均成本投入分别为:消除阶段前期(2005-2009年)为6423.51万元(人员工资占93.05％),消除阶段后期(2010-2015年)1 125.02万元(人员工资84.59％),消除后阶段(2016-2018年)1 170.67万元(人员工资占66.02％,人员培训费占25.37％);NB分别为12.63亿元、20.77亿元和28.45亿元,BCR分别为20.7:1、185.6:1和244.0:1,BCR和NB均是消除后阶段＞消除阶段后期＞消除阶段前期,说明消除后阶段监测措施在经济上最有利,其防治效果是最佳的.结论 福建省疟疾防治工作14年来取得良好的经济和社会效益,疟疾消除后阶段按不同风险等级的疟疾防控管理、加强境外流动人口输入性疟疾防控的监测措施,在经济上有利,防治效果最好.应继续加强疟疾的输入性病例监测管理机制建设,巩固消除疟疾成果.