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用来源于世界不同地区的红麻品种进行细胞学研究表明：染色体数为2n=36；有二对随体，其中一对的大小，随品种类型不同又可分为普通型随体、较大型随体和特大型随体。普通型随体与特大型随体以及另一对随体在杂交F3代中同时显现，呈杂合状态。特大型随体品种与较大型随体和普通型随体品种比较，在种子颜色和千粒重上有显著差异。不同类型品种的染色体均显示着丝点带，有些品种在一对染色体短臂上呈中间带，中间带的有无与品种的花药颜色有一定的关联。