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目的：探讨腹腔镜与开腹手术应用在肝囊肿患者治疗中的临床治疗效果。方法：选取2009年01月～2015年06月我院收治肝囊肿患者50例作为研究对象，按照患者就诊治疗的先后顺序进行分组纳入，参考组25例行常规的开腹手术治疗，分析组25例行腹腔镜与胆道镜再手术治疗，比较两组患者的临床效果。结果：参考组患者手术所需时间、术中出血量、肠胃功能恢复时间、住院时间以及并发症发生机率均低于分析组，对比两组患者数据，数据之间存在较大的差异，差异之间的统计学意义显著(P＜0.05)。结论：腹腔镜手术治疗肝囊肿患者，临床治疗效果佳，该手术安全性高，手术创伤小，能够促进患者恢复，缩短了患者的住院时间，临床推广价值较高。