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卡氏肺孢虫是一种真核条件致病性微生物，感染艾滋病，器官移植，肿瘤等免疫抑制患者，可引起卡氏肺孢子虫肺炎，卡氏肺孢子虫在分类上地位一直存在争议，多认为应归类原虫真菌。８０年代末，卡氏肺孢子虫基因分子生物研究不断深入，一系列研究结果均支持卡氏肺孢子虫是真菌的观点。对卡氏肺孢子虫分子生物学基础研究也取得了一些进展，如对不同宿主源的卡氏肺孢子虫核型建立，和基因组中的一些特异序列的克隆和测序。此外，聚合酶链