基于RNA-Seq的辣木叶转录组研究

来源 :福建农业学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：suxiaohua

【摘要】

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为探讨辣木叶营养价值形成的遗传基础,采用RNA-seq对不同发育时期的辣木叶混合样品进行转录组测序,获得44 056 449个reads,共组装得到75 452条unigene,平均长度为795.69nt,其

【作者】

：

张雅玲王小安潘少霖叶新福

【机构】

：

福建省农业科学院果树研究所

【出处】

：

福建农业学报

【发表日期】

：

2017年10期

【关键词】

：

辣木转录组功能注释

【基金项目】

：

福建省科技计划项目--省属公益类科研院所基本科研专项（2016R1013-8）

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为探讨辣木叶营养价值形成的遗传基础,采用RNA-seq对不同发育时期的辣木叶混合样品进行转录组测序,获得44 056 449个reads,共组装得到75 452条unigene,平均长度为795.69nt,其中有15 824条unigene长度大于1 000nt。采用公共数据库进行同源比对,共有30 847条unigene得到注释。其中,有18 277条unigenes被注释到GO数据库的52个功能组,9 689条unigene在COG数据库中得到注释。有10 130条unigene被富集到129条KEG

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