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采用SRAP标记分析了12个源于四川境内长江主要支流(岷江、青衣江和沱江)流域野生斑茅居群的遗传多样性和遗传结构.结果表明:(1)18对SRAP引物共扩增总条带205条,其中扩增多态性条带153条,占总条带数的74.63％,平均8.5条;(2)研究区域斑茅具有丰富的遗传多样性,各遗传多样性指标水平较高(PPB=74.63％、h=0.2278、I=0.3454);(3)研究区域内斑茅居群具有一定程度的遗传分化(Gst=0.2129),居群内部的遗传变异大于居群间的遗传变异;基因流估计值(Nm)为1.8481;(4)Neis遗传距离将12个斑茅居群分为4类,来自同一流域的材料优先聚为一类.本研究通过对斑茅遗传多样性、遗传结构及聚类结果的分析,推测斑茅是一种异花授粉的广布种,说明了河流影响斑茅居群间基因交流的作用。