基于荧光自淬灭引物的沙门氏菌新型荧光定量PCR方法的开发

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沙门氏菌是一种常见的食源性致病菌,由沙门氏菌引起的食源性疾病位居榜首.荧光定量聚合酶链式反应(fluorescence quantitative polymerase chain reaction,FQ-PCR)是一种准确、可靠的用于核酸定量的扩增技术,常用的荧光探针法使得扩增体系复杂、引物合成成本高.为了简化FQ-PCR的扩增体系,减少标记基团的修饰,拟通过单标记的荧光自淬灭引物实现新型荧光定量聚合酶链式反应(innovative FQ-PCR,IFQ-PCR)用于模板DNA的定量检测.根据沙门氏菌特异性基因设计单标记发卡型荧光自淬灭引物,并将其应用于FQ-PCR实现了沙门氏菌的检测.设计的自淬灭引物探针一体化,只需单标记,无需额外探针或染料的加入,简化了扩增体系,降低了检测成本;同时引物的发卡结构提高了检测特异性.在最优的引物浓度(0.4μmol/L)下,沙门氏菌在101-105 CFU/mL的浓度范围内其浓度的对数值与循环阈值(cycle threshold,CT)值之间呈现良好的线性关系,R2高达0.99,检测限低至2 CFU/mL,并且在1.5 h内即可完成扩增检测,方法的稳定性符合要求.因此,一种基于荧光自淬灭引物的IFQ-PCR方法被开发出来并实现了沙门氏菌的简便、快速、灵敏、特异、低成本的检测.
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