【摘 要】
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采用Illumina测序技术对在醋酸钙、硫酸铵和蔗糖处理后蓝莓不同发育阶段的果实进行转录组测序,获得Clean Reads 2 723 731 442条,经组装得到平均长度为753.65 nt的87 608条Un
【机 构】
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凯里学院大健康学院,凯里,556000
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采用Illumina测序技术对在醋酸钙、硫酸铵和蔗糖处理后蓝莓不同发育阶段的果实进行转录组测序,获得Clean Reads 2 723 731 442条,经组装得到平均长度为753.65 nt的87 608条Unigene.将转录组Unigene进行基因功能注释,其中39 867条Unigene能被NR数据库注释,与葡萄同源序列最多,占8.58%;与GO数据库比对发现,有29 661条Unigene获得注释,分别匹配到生物过程、细胞组成和分子功能三大类共59个分支;与KOG数据库进行比对,发现有21992条Unigene具有功能信息,分别涉及25类;根据KEGG数据库的注释信息进行Pathway注释,参与的代谢通路共有246条;共检测到8 704个SSR位点,其中双碱基重复的SSR占78.57%.本研究为探索外源物质调控蓝莓果实生长发育、生理代谢的分子机理提供了理论基础.
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